Forschungsprojekte
InGeniS

Ziel von InGeniS war es, ein routinemäßig einsetzbares Zuchtwertschätzverfahren für die genomische Selektion unter Einbeziehung der Rasse Piétrain aufzubauen inklusive der dazugehörigen Logistik. Ein zweites und gleichrangiges Ziel war die Durchführung genomweiter Assoziationsstudien auf der Basis von imputierten Sequenzinformationen für die Rassen Deutsche Landrasse und Piétrain.

Die Bearbeitung des Projekts konnte erfolgreich abgeschlossen werden. Bayern als einziges Land unter den verbliebenen Herdbuchzuchten (Baden-Württemberg, Österreich, Schweiz) verfügt nun über eine vollständige Implementierung von genomischen Zuchtwertschätzungen mit dem One-Step-Verfahren für Vater- und Mutterrassen und hat diese voll in die Routine-Zuchtwertschätzungen implementiert. Die Umsetzung des modifizierten Zuchtprogramms durch die Zucht- und Besamungsorganisationen hat begonnen und die EGZH hat durch geeignete Beschlüsse dafür Sorge getragen, dass nicht nur männliche Selektionskandidaten typisiert werden, sondern auch der komplette Sauenbestand bei Piétrain und Deutscher Landrasse. Als wichtiger Nebeneffekt ergibt sich eine deutlich verbesserte Abstammungssicherheit der bayerischen Zuchttiere.

Im Hinblick auf die genomweiten Assoziationsstudien sind die Arbeiten zwar erfolgreich durchgeführt worden, es sind jedoch nur wenige praktisch umsetzbare Ergebnisse erzielt worden. Die Sequenzierung der wichtigsten Vorfahren konnte erfolgreich durchgeführt werden und diese Ergebnisse stehen auch für zukünftige Studien zur Verfügung. Die Imputation der Genotypen auf Sequenzen erbrachte dagegen keine brauchbaren Ergebnisse, weil die Strukturen beim Schwein ungünstiger sind als beim Rind. Darunter litt auch die genomweite Assoziationsstudie. Dennoch konnte mit dem Genort BMP15 ein interessanter Effekt entdeckt und die Träger der unerwünschten Variante konsequent eliminiert werden.

Sowohl bei der Sequenzierung als auch bei der Klärung von Abstammungskonflikten mit Beginn der Routine hat es sich als sehr nachteilig herausgestellt, dass nicht von allen bedeutenden Zuchttieren Material eingelagert worden war. Als eine wichtige Schlussfolgerung für die Praxis ist deshalb festzuhalten, dass zukünftig von allen ins Herdbuch eingetragenen Tieren genetisches Material eingelagert werden sollte.

Detaillierte Ergebnisse wurden in zahlreichen Vorträgen und Veröffentlichungen präsentiert.