Zukunftswege

Die genomische Selektion bei Fleckvieh und Braunvieh ist im Rahmen verschiedener gemeinschaftlicher Forschungsprojekte entwickelt worden und wurde im Laufe des Jahres 2011 in die Zuchtpraxis bei Fleckvieh und Braunvieh eingeführt. Mit dem Projekt Zukunftswege sollen die rasanten technischen und methodischen Entwicklungen auf dem Gebiet der genomischen Selektion begleitet und in Verbindung mit zahlreichen Fragestellungen zur Weiterentwicklung der nationalen Verfahren bearbeitet werden. Bei den Fragestellungen zur Nutzung von verschiedenen SNP-Chipdaten, der Weiterentwicklung von genomischen Zuchtwertschätzverfahren und der Nutzung von weiblichen Tieren in der genomischen Lernstichprobe stehen die Umsetzung der Erkenntnisse in die nationalen Zuchtprogramme im Vordergrund.

Die Arbeiten werden basierend auf dem Genotypenpool der gemeinsamen Zuchtwertschätzung von Deutschland und Österreich für die Rassen Braunvieh und Fleckvieh durchgeführt.

Die Bewertung der Ergebnisse erfolgt mit Hilfe von Validierungsstudien, in denen die Vorhersagequalität der Verfahren beurteilt werden kann. Neben den Arbeiten an vorliegenden Genotypen wird zur Frage der Nutzung von Kuhgenotypen eine umfangreiche Simulationsstudie durchgeführt.

Die Ergebnisse zu den bisher behandelten Fragestellungen werden in den unten aufgeführten Veröffentlichungen detailliert beschrieben.

Die Ergebnisse zur Struktur der vorliegenden Rassen und die damit verbundene Möglichkeit einer Berücksichtigung von heterogenen Basispopulationen zeigen Vorteile bei der Bearbeitung von distinkten Subpopulationen am Beispiel der Rasse Braunvieh (Plieschke et al., 2014b, 2014c, 2015a).

Die Arbeiten zur Nutzung von hochdichten SNP-Genotypen in der genomischen Zuchtwertschätzung zeigen nur geringe Vorteile im Vergleich zu den aktuell genutzten Standard 50k SNP-Genotypen (Pimentel et al., 2014). Die Möglichkeiten zur Sequenzimputation werden durch die vorliegenden hoch dichten Genotypen deutlich verbessert (Pausch et al., 2013). Durch das Verfahren der Imputation können niedrig dichte SNP-Chipdaten auf den Standard-Chip hochgerechnet werden (Plieschke et al., 2014a). Diese Imputation geht jedoch mit einer Verzerrung von Zuchtwerten bei Spitzentieren einher (Pimentel et al., 2015).

Die bisherigen Ergebnisse zu den Arbeiten mit sogenannten Single-Step GBLUP Verfahren, bei denen die genotypisierten Tiere direkt in die konventionellen Zuchtwertschätzverfahren einbezogen werden sehen vielversprechend aus und werden exemplarisch bei Exterieurmerkmalen getestet (Pimentel et al., 2016).

Ergebnisse der Simulationsstudien zur systematischen Nutzung von Kuhgenotypen in der Lernstichprobe zeigen deutlich positive Effekte auf die Vorhersagequalität der genomischen Zuchtwerte (Edel et al. 2016a, Plieschke et al. 2015c, 2016a, 2016b, 2016c). Die Simulationsergebnisse zeigen jedoch deutlich, dass die Töchterauswahl zufällig erfolgen muss und nicht aus selektierten besseren Töchtern bestehen darf, da ansonsten Verzerrungen bei der Schätzung der genomischen Zuchtwerte auftreten.

Die Erkenntnisse aus der Simulationsstudie wurden im Rahmen einer einberufenen länderübergreifenden Arbeitsgruppe mit Zuchtverbänden, Besamungsstationen und Rassedachverbänden im Juni 2016 vorgestellt. Die Möglichkeiten einer Umsetzung im Rahmen der länderübergreifenden Genomischen Selektion werden aktuell erarbeitet.